依照《中華人民共和國發票管理辦法》第二十一條的規定，一切從事生產經營活動的單位和個人，對購買的貨物、接受的服務和其他經營活動支付價款。應向收款人索取發票。
因此，公司在支付工程款時應當進行索取發票。按照《營業稅暫行工作條例》規定，建筑業發展勞務的納稅時間地點為建筑業提供勞務發生地繳納營業稅，因此，施工建設單位人員應當在中國建筑工程項目所在地開具電子發票或向建筑技術項目所在地主管地稅機關申請代開發票。那么申請工程款發票有哪些規定呢，上海工程款律師整理了《工程款發票有哪些規定》的相關內容。
開具發票的程序和數據要求：
一、納稅人到建筑工程項目公司所在地政府主管地稅機關辦稅人員服務中心大廳領取并填寫《代開發票申請表》一份
二、納稅人應當提供信息
1.需出示的資料
1)申請人的合法身份證件
2)稅務注冊登記證(副本)原件、復印件
2.需報送的資料
1)付款人出具的施工服務名稱、單價和金額的書面確認證明或建筑安裝合同
2)異地施工的，施工企業單位組織機構所在地主管地稅機關開具的《外出經營發展活動稅收風險管理研究證明》。
三、稅務機關承諾的期限
如所提供資料齊全，填寫內容準確，手續齊全，應當場完成。
四、稅務管理機關可以采取“先繳稅、后開發票”辦法，普遍認為采用一窗式服務，即，一個重要窗口工作完成企業繳稅、代開發票事項。綜合利用稅率大約在5.8%左右，各地發展不一。
五、工程款發票開具注意什么事項
1、根據提供建筑服務的不同類型，選擇不同的服務項目。
如：建筑服務-工程服務、建筑服務-安裝服務、建筑服務-其他建筑服務等。
2、正確地選擇適用稅率或征收率。
建筑企業一般納稅人為一般計稅項目提供的建筑服務，包括2016年5月1日之后開工的工程項目及2016年5月1日之前開工但甲方選擇一般計稅方式的建筑工程項目，增值稅率為9%。
建筑企業提供下列建筑服務，實行簡易計稅，增值稅征收率為3%：
(1)為適用簡易計稅的建筑工程老項目提供建筑服務
(2)為清包工工程提供建筑服務
(3)為甲供工程提供的建筑服務
(4)小規模納稅人提供的建筑服務。
適用稅率或征收率的高低直接影響到企業應納增值稅額，所以一定要準確選擇。
3、正確地填寫備注欄信息。
建筑企業開具發票時，包括自行開具和由稅務機關代開增值稅發票，均應在發票的備注欄注明建筑服務發生地縣(市、區)名稱及項目名稱。同時，稅務機關為異地提供建筑服務的小規模納稅人代開發票時，須在發票備注欄中打印"YD"字樣
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